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1、
課題1 DNA的粗提取與鑒定
教材內(nèi)容解讀
要點(diǎn)1 提取DNA的方法
(1)分離
選用一定的物理或化學(xué)方法分離具有不同物理或化學(xué)性質(zhì)的生物大分子。
(2)DNA的溶解性
DNA和蛋白質(zhì)等其他成分在不同濃度的NaCl溶液中溶解度不同,DNA在NaCl溶液中的溶解度隨NaCl的濃度變化,在0.14mol/L的NaCl溶液中溶解度最低。選擇適當(dāng)?shù)柠}溶液就能使DNA充分溶解,而使雜質(zhì)沉淀,在0.14mol/L的NaCl溶液中DNA會(huì)析出。
DNA不溶于酒精溶液,但是細(xì)胞中的某些蛋白質(zhì)則溶于酒精。利用這一原理,可以將DNA與蛋白質(zhì)進(jìn)一步分離。
(3)DNA對(duì)酶、高溫和洗滌劑的耐受性
2、
蛋白酶能水解蛋白質(zhì),但是對(duì)DNA沒有影響。大多數(shù)蛋白質(zhì)不能忍受60~80℃的高溫,而DNA在80℃以上才會(huì)變性。洗滌劑能夠瓦解細(xì)胞膜,但對(duì)DNA沒有影響。
(4)DNA的鑒定
在沸水浴的條件下,DNA遇二苯胺會(huì)被染成藍(lán)色。二苯胺可以作為鑒定DNA的試劑。
要點(diǎn)2 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
(1)實(shí)驗(yàn)材料的選取
選用DNA含量相對(duì)較高的生物組織,如雞血。
(2)破碎細(xì)胞,獲取含DNA的濾液
動(dòng)物細(xì)胞以雞血為例,在雞血細(xì)胞液中加入一定量的蒸餾水,同時(shí)用玻璃棒攪拌,過(guò)濾后收集濾液即可。
植物細(xì)胞需要先用洗滌劑溶解細(xì)胞膜。
(3)去除濾液中的雜質(zhì)
方法有三種:
①在濾液中加入NaCl,使NaC
3、l溶液濃度為2mol/L,過(guò)濾除去不溶的雜質(zhì),再調(diào)節(jié)NaCl溶液濃度為0.14mol/L,析出DNA過(guò)濾去除溶液中的雜質(zhì),再用2mol/L的NaCl溶液溶解DNA。
②直接在濾液中加入嫩肉粉反應(yīng)10~15分鐘,嫩肉粉中的木瓜蛋白質(zhì)酶能夠分解蛋白質(zhì)。
③將濾液放在60~75℃的恒溫水浴箱中保溫10~15分鐘。
(4)DNA的析出與鑒定
①析出較純凈的DNA
將處理后的溶液過(guò)濾,加入與溶液體積相等的、冷卻的酒精溶液(體積分?jǐn)?shù)為95%),靜置2~3分鐘,溶液中會(huì)出現(xiàn)白色絲狀物,并用濾紙吸去上面的水分。
②DNA的鑒定
取兩支20mL的試管,各加入物質(zhì)的量濃度為2mol/L的NaCl溶液
4、5mL,將絲狀物放入其中一支試管中,用玻璃棒攪拌,使絲狀物溶解。然后,向兩支試管中各加入4mL的二苯胺試劑?;旌暇鶆蚝?,將試管置于沸水中加熱5分鐘,待試管冷卻后,比較兩支試管中溶液顏色的變化。溶解有DNA的溶液變藍(lán)。
要點(diǎn)3 實(shí)驗(yàn)案例
案例一以雞血為實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行DNA的粗提取
課前準(zhǔn)備
本實(shí)驗(yàn)用雞血細(xì)胞做實(shí)驗(yàn)材料有兩個(gè)原因。一是因?yàn)殡u血細(xì)胞核的DNA含量豐富,材料易得;二是雞血細(xì)胞極易吸水脹破,而用動(dòng)物肝臟細(xì)胞作實(shí)驗(yàn)材料常常需要?jiǎng)驖{和離心,對(duì)設(shè)備要求較高,操作繁瑣,歷時(shí)較長(zhǎng)。
教師可以到市場(chǎng)售活雞處索取雞血,所帶燒杯中必須提前放入抗凝劑檸檬酸鈉溶液。具體制備方法如下。取質(zhì)量濃度為0.
5、1g/mL的檸檬酸鈉溶液100mL,置于500mL燒杯中,注入新鮮的雞血(約180mL),同時(shí)用玻璃棒攪拌,使血液與檸檬酸鈉溶液充分混合,以免血液凝結(jié)。將燒杯中的血液置于冰箱內(nèi),靜置1d,使血細(xì)胞自行沉淀。有條件的學(xué)校也可以將血液倒入離心管內(nèi)進(jìn)行離心,用2000r/min或3000r/min的轉(zhuǎn)速,離心2min,使血細(xì)胞沉淀于離心管底部,這樣可以使血細(xì)胞沉淀更完全。用吸管除去上部的澄清液,就可以得到雞血細(xì)胞液。值得注意的是雞血細(xì)胞破碎以后釋放出的DNA,容易被玻璃容器吸附,所以在提取過(guò)程中為了減少DNA的損失,最好使用塑料的燒杯和試管盛放雞血細(xì)胞液。
提取DNA的具體步驟
1.破碎細(xì)胞,釋
6、放DNA
雞血細(xì)胞中的DNA與核蛋白結(jié)合,位于雞血細(xì)胞的細(xì)胞核中,正常情況下是不會(huì)釋放出來(lái)的。為了使DNA從細(xì)胞核中釋放出來(lái),需要向雞血細(xì)胞液中加入蒸餾水,并且攪拌,從而使血細(xì)胞膜和核膜脹破。用玻璃棒攪拌可以加速細(xì)胞的破裂。注意應(yīng)沿一個(gè)方向快速攪拌,但也不能太快太猛,防止打碎DNA。一般5~10mL的雞血細(xì)胞液加入20mL蒸餾水?dāng)嚢?min。釋放出來(lái)的大量DNA和RNA往往與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起,應(yīng)用3~4層紗布進(jìn)行過(guò)濾,除去一些顆粒較大的雜質(zhì)。
2.溶解細(xì)胞核內(nèi)的DNA
在濃度較高的NaCl溶液中核蛋白容易解聚,游離出的DNA溶解在溶液中。在溶液中加入兩倍體積的濃度為2mol/L的NaCl
7、溶液,攪拌1min。注意應(yīng)沿一個(gè)方向攪拌,使DNA充分溶解。
3.DNA的析出
將溶液中的DNA與其他雜質(zhì)分離,這一步驟是實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵。教材中列舉了提取DNA的三種方案,本案例選取方案一。加蒸餾水降低NaCl溶液濃度,使DNA析出。實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該緩慢貼壁加入蒸餾水,并輕輕地沿一個(gè)方向不停地均勻攪拌,以利于DNA分子的附著和纏繞。同時(shí)應(yīng)注意控制加水量,使NaCl溶液的終濃度為0.1~0.2mol/L。加水過(guò)程一般分三次進(jìn)行,當(dāng)總加水量為300mL左右時(shí),DNA已基本析出。加水太多、溶液過(guò)稀,會(huì)使DNA分子又重新溶解。
用3~4層紗布對(duì)DNA稀釋液進(jìn)行過(guò)濾,濾去蛋白質(zhì),收集DNA的黏稠物。如果
8、采用離心法,效果更好。用4000r/min轉(zhuǎn)速的離心機(jī),離心15min,除去上清液(含有蛋白質(zhì)),留下的沉淀物中含有DNA。此時(shí)注意觀察DNA黏稠物的顏色。
4.DNA的初步純化
如果提取的DNA量不夠多且其中含有較多雜質(zhì),或者加入溶液和攪拌等操作過(guò)程不規(guī)范,都會(huì)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象不明顯,常常使制取的DNA粗制品不能顯示出DNA的本色──白色。為了增進(jìn)實(shí)驗(yàn)效果,需要對(duì)DNA粗制品進(jìn)行簡(jiǎn)單的提純,下面的方案可供參考。
將DNA黏稠物再溶解,繼續(xù)用2mol/L的NaCl溶液20mL溶解DNA黏稠物,仍舊沿一個(gè)方向不停攪拌3min,使DNA充分溶解,以免損失。用3~4層紗布進(jìn)行過(guò)濾(或離心),濾去雜
9、質(zhì),收集含有DNA的濾液。向?yàn)V液中貼壁緩慢加入50mL預(yù)冷的體積分?jǐn)?shù)為95%的乙醇,并用玻璃棒朝一個(gè)方向緩慢、均勻地?cái)嚢瑁芤褐袝?huì)出現(xiàn)DNA絲狀物。
實(shí)驗(yàn)一般要求采用預(yù)冷的95%的乙醇,但對(duì)比結(jié)果顯示,常溫下的乙醇溶液也可產(chǎn)生明顯效果。從理論上分析,預(yù)冷的乙醇溶液具有以下優(yōu)點(diǎn)。一是抑制核酸水解酶活性,防止DNA降解;二是降低分子運(yùn)動(dòng),易于形成沉淀析出;三是低溫有利于增加DNA分子柔韌性,減少斷裂。此時(shí)懸浮于溶液中的DNA絲狀物相對(duì)含雜質(zhì)較少,如果出現(xiàn)的絲狀物較少,可以將此混合液再放入冰箱中冷卻幾分鐘。濃縮后的DNA絲狀物,可以用緩緩旋轉(zhuǎn)玻璃棒的方法卷起(因?yàn)椴AО粲形紻NA的作用)。如果D
10、NA絲狀物較少,不易吸附在玻璃棒上,也可以用筷子等表面粗糙的用具來(lái)幫助DNA分子纏繞。
DNA的純化還有許多其他方法。例如,添加質(zhì)量分?jǐn)?shù)為25%的十二烷基磺酸鈉(SDS)溶液,使蛋白質(zhì)變性后與DNA分開。隨后,加入氯仿—異丙醇混合液(體積比為24∶1),通過(guò)離心將蛋白質(zhì)及其他雜質(zhì)除去,取上清液??芍貜?fù)上述操作幾次,直至上清液變成透明的黏稠液體。此外苯酚可以迅速使蛋白質(zhì)變性,抑制核酸酶的活性。利用苯酚處理后,離心分層,DNA溶于上層水相,蛋白質(zhì)變性存在于酚層中,這時(shí)可用分液漏斗或吸管等儀器將二者分開。教師可以根據(jù)學(xué)校的條件讓學(xué)生自己設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案,比較實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
5.DNA的鑒定
二苯胺法二
11、苯胺試劑的配制及鑒定DNA的方法參見教科書。需要注意的是,二苯胺試劑在冰箱內(nèi)可保存6個(gè)月,使用前需搖勻。
紫外燈照射法用蒸餾水配制質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.05%的溴化乙錠(EB)溶液,將玻璃棒上纏繞的白色絮狀物抹到蠟紙上,再滴1滴EB溶液染色。將蠟紙放在紫外燈(260nm)下照射(暗室中),可呈現(xiàn)橙紅色的螢光(DNA的紫外吸收高峰在260nm處)。
電泳法此方法適合鑒定純度較高的DNA。有條件的學(xué)??梢詤⒖急緦n}課題2的實(shí)驗(yàn)案例和參考資料部分。
案例二以菜花為實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行DNA的粗提取
課前準(zhǔn)備將新鮮菜花和體積分?jǐn)?shù)為95%的乙醇溶液放入冰箱冷凍室24h。
提取DNA的具體步驟
1.取材稱取3
12、0g菜花,去梗取花,切碎。
2.研磨將碎菜花放入研缽中,倒入10mL研磨液,充分研磨10min。
研磨液的配制方法如下。將10.1gTris(三羥甲基氨基甲烷)加入到50mL蒸餾水中,使其溶解,然后,用2moL/L的HCl溶液調(diào)節(jié)pH至8.0,再加入8.76gNaCl、37.2gEDTA、20gSDS。待上述藥品全部溶解后,再用蒸餾水定容至1000mL。
教材中建議采用洗發(fā)香波、洗滌劑等一些去污劑,使植物細(xì)胞膜破碎,釋放DNA。學(xué)生可以設(shè)置對(duì)照實(shí)驗(yàn),比較哪一種方法可以提取到純度更高的DNA。一般實(shí)驗(yàn)室提取高純度的DNA都采用一種陽(yáng)離子去污劑──十六烷三甲基溴化銨分離緩沖液,使細(xì)胞膜破碎,
13、同時(shí)將DNA與植物中多糖等雜質(zhì)分開,再用氯仿—異丙醇混合液(體積比為24∶1)抽提去除雜質(zhì)蛋白,得到高純度的DNA。
3.過(guò)濾在漏斗中墊上尼龍紗布,將菜花研磨液過(guò)濾到燒杯中(有條件的學(xué)??蓪V液倒入塑料離心管中進(jìn)行離心,用1000r/min的轉(zhuǎn)速,離心2~5min,取上清液放入燒杯中)。在4℃冰箱中放置幾分鐘后,再取上清液。
4.沉淀將一倍體積的上清液倒入兩倍體積的體積分?jǐn)?shù)為95%的預(yù)冷乙醇溶液中,并用玻璃棒緩緩、輕輕地?cái)嚢枞芤?玻璃棒不要直插到燒杯底部)。沉淀3~5min后,可見白色的DNA絮狀物出現(xiàn)。用玻璃棒緩緩旋轉(zhuǎn),將絮狀物纏繞在玻璃棒上。
要點(diǎn)4 疑難解答
(1)為什么加入蒸餾
14、水能使雞血細(xì)胞破裂?
蒸餾水對(duì)于雞血細(xì)胞來(lái)說(shuō)是一種低滲液體,水分可以大量進(jìn)入血細(xì)胞內(nèi),使血細(xì)胞脹裂,再加上攪拌的機(jī)械作用,就加速了雞血細(xì)胞的破裂(細(xì)胞膜和核膜的破裂),從而釋放出DNA。
(2)在切碎的洋蔥加入洗滌劑和食鹽的作用分別是什么?
洗滌劑是一些離子去污劑,能溶解細(xì)胞膜,有利于DNA的釋放;食鹽的主要成分是NaCl,有利于DNA的溶解。
(3)提取洋蔥DNA時(shí)如果研磨不充分,會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生怎樣的影響?
研磨不充分會(huì)使細(xì)胞核內(nèi)的DNA釋放不完全,提取的DNA量變少,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,導(dǎo)致看不到絲狀沉淀物、用二苯胺鑒定不顯示藍(lán)色等。
(4)為什么反復(fù)地溶解與析出DNA,能夠去除雜
15、質(zhì)?
用高鹽濃度的溶液溶解DNA,能除去在高鹽中不能溶解的雜質(zhì);用低鹽濃度使DNA析出,能除去溶解在低鹽溶液中的雜質(zhì)。因此,通過(guò)反復(fù)溶解與析出DNA,就能夠除去與DNA溶解度不同的多種雜質(zhì)。
要點(diǎn)5 參考資料
1.二苯胺鑒定DNA的化學(xué)原理
DNA中嘌呤核苷酸上的脫氧核糖遇酸生成ω-羥基-γ酮基戊醛,它再和二苯胺作用而呈現(xiàn)藍(lán)色(溶液呈淺藍(lán)色)。鑒定時(shí)溶液藍(lán)色的深淺,與溶液中DNA含量的多少有關(guān)。
2.研磨液中幾種藥品的作用
Tris/HCl:提供緩沖體系,DNA在這一體系中呈穩(wěn)定態(tài)(Tris為三羥甲基氨基甲烷)。
EDTA(乙二胺四乙酸二鈉):是DNA酶的抑制劑,可以防止細(xì)胞破碎后DNA酶降解DNA。
SDS(十二烷基磺酸鈉):可以使蛋白質(zhì)變性,與DNA分離。